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Sun Bio-ClusterGrid

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La Iniciativa Sun Bio-ClusterGrid se desarrolla con la intención de proporcionar a biólogos que trabajen en Investigación de Ciencias de la Vida, una suite de aplicaciones bioinformáticas.


Los componentes de Bio-ClusterGrid son:

  • Sistema operativo Solaris.
  • Aplicaciones bioinformáticas listas para usar.
  • Base de datos de ejemplos.
  • Sun Grid Engine (SGE).
  • Grid Engine Portal (GEP).


Las aplicaciones incluidas en el paquete informático son las siguientes:

  • Búsquedas de similaridad y homología: Biodas, Blast, Fasta, GlimmerM, Wise.
  • Análisis de secuencias: ACT, ClustalW, EMBOSS, HMMER, Image, T-Coffee.
  • Predicción estructural: DOWSER, FastDNAml, LOOPP, MapMaker/QTL, PAML, PHYLIP, VMD.
  • Modelado e imagen molecular: Artemis, Cn3D, GROMACS, RasMol, ReadSeq, TribeMCL.
  • Otros: Biojava, Bioperl, Biopython.

El software cedido se utilizará conforme a los términos de las licencias y no estará permitido el uso con fines distintos al interno de la Universidad y el educativo o investigador. El CSIRC lo pone a disposición de la comunidad universitaria aunque no ofrece soporte para su instalación y/o configuración.

 

Disclaimer: "Google translator" is showed in the upper part of the site in order to help to translate into other languages. CSIRC is not responsible for its quality.

tfno: 958 241 010 * fax: 958 244 221 * email: csirc@ugr.es
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